Difference between revisions of "Adding kernels for jupyterhub"
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En pyconda hay un archivo llamado kernel.json en el se debe editar display_name y organizar los LD_LIBRARY_PATH y PYTHONPATH: | En pyconda hay un archivo llamado kernel.json en el se debe editar display_name y organizar los LD_LIBRARY_PATH y PYTHONPATH: | ||
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Latest revision as of 20:20, 26 May 2016
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Adición de kernels a jupyterhub
Asegurandose que no queden "residuos" en el $PYTHONPATH (directrices que enlacen a las capetas de paquetes de las diferentes instancias de python), ejecutar lo siguiente:
/usr/local/anaconda/bin/ipython kernelspec install-self --user
Esto crea una definición de kernel para jupyter en ~/.local/share/jupyter/kernels En el paso anterior se creo en el directorio indicado una carpeta con un nombre, normalmente python2 o python3, se debe modificar por ejemplo a pyconda.
cd ~/.local/share/jupyter/kernels
mv python2 pyconda
Hay que mover eso a /usr/local/share/jupyter/kernels/ En esa carpeta estan todas las definiciones de kernels.
mv pyconda /usr/local/share/jupyter/kernels/
En pyconda hay un archivo llamado kernel.json en el se debe editar display_name y organizar los LD_LIBRARY_PATH y PYTHONPATH:
File: /usr/local/share/jupyter/kernels/kernel.json
{
"display_name": "Python 2 + Anaconda",
"language": "python",
"argv": [
"/usr/local/anaconda/bin/python",
"-m",
"IPython.kernel",
"-f",
"{connection_file}"
],
"env": {
"LD_LIBRARY_PATH": "/usr/local/gpstk-anaconda/lib/:/usr/local/madagascar/lib:/usr/local/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.x/platforms/linux64Gcc/gperftools-svn/lib:/usr/local/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.x/platforms/linux64Gcc/ParaView-4.1.0/lib/paraview-4.1:/usr/local/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system:/usr/local/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system:/usr/local/openmpi/lib:/root/OpenFOAM/root-2.4.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib:/usr/local/OpenFOAM/site/2.4.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib:/usr/local/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib:/usr/local/OpenFOAM/ThirdParty-2.4.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib:/usr/local/OpenFOAM/OpenFOAM-2.4.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib/dummy:/usr/local/gromacs-5.0.5/lib:/usr/local/cuda/lib64:/usr/local/intel/composer_xe_2015.3.187/compiler/lib/intel64:/usr/local/intel/composer_xe_2015.3.187/mpirt/lib/intel64:/usr/local/intel/composer_xe_2015.3.187/ipp/../compiler/lib/intel64:/usr/local/intel/composer_xe_2015.3.187/ipp/lib/intel64:/usr/local/intel/composer_xe_2015.3.187/ipp/tools/intel64/perfsys:/usr/local/intel/composer_xe_2015.3.187/mkl/lib/intel64:/usr/local/intel/composer_xe_2015.3.187/tbb/lib/intel64/gcc4.4:/usr/local/intel/composer_xe_2015.3.187/debugger/libipt/intel64/lib:/usr/lib/openblas-base:/usr/lib/atlas-base:/usr/local/glog-0.3.3/lib/",
"PYTHONPATH": "/usr/local/anaconda/bin:/usr/local/anaconda/lib/python2.7/site-packages:/usr/local/caffeDigits/python/:/usr/local/caffeDigits/python/caffe/proto/:/usr/local/pylearn2/:/usr/local/caffe/python/:/usr/local/madagascar/lib/python2.7/dist-packages"
}
}
De esta manera se pueden generar kernels para cualquier version de python.
